More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0775 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 479 aa  942    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.14 
 
 		 421 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.92 
 
 		 421 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  44.61 
 
 		 461 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.6 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  42.65 
 
 		 471 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  42.89 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  31.18 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.08 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.78 
 
 		 335 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.55 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.88 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.22 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  28.69 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.36 
 
 		 329 aa  100  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 517 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  28.81 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 432 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  30.83 
 
 		 361 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.17 
 
 		 376 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  31.72 
 
 		 401 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  26.15 
 
 		 359 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  28.57 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  25.93 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  23.06 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 379 aa  95.1  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  28.98 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  30.71 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  30.71 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 448 aa  95.1  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  28.57 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  30.71 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 407 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 512 aa  94.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  34.34 
 
 		 468 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  27.55 
 
 		 350 aa  94  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  27.94 
 
 		 489 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 380 aa  93.6  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  29.22 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.16 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.42 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.95 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  29.2 
 
 		 365 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.83 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 393 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.2 
 
 		 356 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  29.46 
 
 		 349 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 377 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  31.87 
 
 		 546 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.72 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  28.43 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  30.27 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  28.63 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 353 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  25.22 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.94 
 
 		 365 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 426 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 429 aa  87.8  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  29.11 
 
 		 360 aa  87.4  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 475 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 609 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 		 475 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 		 470 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  28.89 
 
 		 373 aa  87  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.48 
 
 		 350 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 		 370 aa  86.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 410 aa  86.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  25.7 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  28.9 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  29.59 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  31.82 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  31.05 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.55 
 
 		 607 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  31 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  26.7 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>