More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2543 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  100 
 
 		 471 aa  935    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  66.82 
 
 		 461 aa  554  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.66 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.91 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  48.72 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.38 
 
 		 479 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  32.26 
 
 		 399 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.4 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  27.18 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.01 
 
 		 386 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30.26 
 
 		 329 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  31.35 
 
 		 334 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  27.86 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  24.86 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  27.97 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.76 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.96 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.76 
 
 		 328 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  27.72 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  24.49 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.08 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  29.49 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.17 
 
 		 353 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.93 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  21.67 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  25.71 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2869  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 337 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000418866  normal  0.697235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25.13 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  28.72 
 
 		 523 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.01 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.6 
 
 		 328 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  30.4 
 
 		 331 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.6 
 
 		 328 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 		 354 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 337 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000223326  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 347 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  28.49 
 
 		 338 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  29.24 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25.76 
 
 		 368 aa  97.1  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2774  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 337 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000348854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 		 438 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 364 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 347 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  27.96 
 
 		 338 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  28.83 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2794  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  27.67 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  26.21 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  29.63 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.43 
 
 		 354 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  23.62 
 
 		 334 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  25.41 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 337 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  31.2 
 
 		 331 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  31.2 
 
 		 331 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  25.65 
 
 		 368 aa  94.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3102  AcrA/AcrE family protein  26.57 
 
 		 337 aa  94  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 372 aa  94  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  23.6 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 438 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.37 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  27.86 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 427 aa  93.6  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  32.35 
 
 		 540 aa  93.6  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  30.95 
 
 		 342 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.35 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  30.8 
 
 		 331 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  30.8 
 
 		 331 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  24.24 
 
 		 408 aa  92.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  30.8 
 
 		 331 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  25.59 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  30.53 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.66 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>