More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4050 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 517 aa  1028    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  88.39 
 
 		 512 aa  908    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.14 
 
 		 537 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  45.21 
 
 		 538 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  46.62 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  46.29 
 
 		 504 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  43.74 
 
 		 537 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  47.38 
 
 		 537 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  43.43 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  47.76 
 
 		 422 aa  348  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  46.45 
 
 		 550 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.67 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  46.89 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.71 
 
 		 509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  46.56 
 
 		 498 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  46.46 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  43.96 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.47 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  44.33 
 
 		 475 aa  300  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.67 
 
 		 486 aa  300  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  45 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 		 477 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  43.03 
 
 		 462 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  42.57 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  44.56 
 
 		 472 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  38.6 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  43.35 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  45.24 
 
 		 518 aa  286  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  38.32 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  44.53 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  36.29 
 
 		 491 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  41.52 
 
 		 451 aa  283  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  34.99 
 
 		 672 aa  280  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  35.56 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.73 
 
 		 568 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.41 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  40.82 
 
 		 475 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  37.35 
 
 		 552 aa  266  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  36.29 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  33.47 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  32.8 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.65 
 
 		 497 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  37.21 
 
 		 500 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  37.95 
 
 		 545 aa  257  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  37.79 
 
 		 683 aa  257  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  39.49 
 
 		 715 aa  256  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.83 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.05 
 
 		 457 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  32.58 
 
 		 529 aa  253  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  42.9 
 
 		 527 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  38.48 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  33.68 
 
 		 483 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.21 
 
 		 497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  33.4 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.73 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.73 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  36.26 
 
 		 490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  40.73 
 
 		 504 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  33.58 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  34.02 
 
 		 513 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 581 aa  236  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.4 
 
 		 507 aa  236  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  37.56 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.56 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  34.89 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  35.52 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.63 
 
 		 510 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  33.01 
 
 		 521 aa  233  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  34.26 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 		 523 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  32.23 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.07 
 
 		 526 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  37.41 
 
 		 542 aa  229  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  34.68 
 
 		 509 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.05 
 
 		 497 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 523 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5181  RND family efflux transporter MFP subunit  33.97 
 
 		 505 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 507 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.82 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.82 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 		 510 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 		 507 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  33.91 
 
 		 507 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.94 
 
 		 438 aa  223  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  33.18 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  33.54 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  39.13 
 
 		 625 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  37.08 
 
 		 497 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  33.47 
 
 		 487 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  33.2 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  32.76 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  34.4 
 
 		 410 aa  212  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>