More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2479 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  64.48 
 
 
546 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  100 
 
 
504 aa  1021    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  63.31 
 
 
537 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.92 
 
 
537 aa  623  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  61.4 
 
 
538 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  58.64 
 
 
537 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  48.59 
 
 
540 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  48.16 
 
 
517 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.56 
 
 
512 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  48.62 
 
 
422 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  47.11 
 
 
550 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  47.29 
 
 
477 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  46.58 
 
 
478 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.41 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  45.09 
 
 
474 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  46.3 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  45.74 
 
 
475 aa  329  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  44.79 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  47.88 
 
 
473 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  44.79 
 
 
472 aa  326  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.95 
 
 
486 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  45.99 
 
 
451 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.26 
 
 
508 aa  323  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  44.97 
 
 
472 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  45.62 
 
 
477 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.04 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.11 
 
 
509 aa  319  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  45.21 
 
 
471 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  45.28 
 
 
498 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  44.27 
 
 
470 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  40.85 
 
 
475 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 
502 aa  293  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.21 
 
 
568 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  37.47 
 
 
467 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  43.32 
 
 
518 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  40.53 
 
 
500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  39.04 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  35.13 
 
 
509 aa  273  5.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  32.19 
 
 
629 aa  273  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  40.48 
 
 
377 aa  270  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  41.57 
 
 
504 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  32.97 
 
 
491 aa  264  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  38.74 
 
 
683 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  32.13 
 
 
672 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  39.63 
 
 
715 aa  259  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  31.4 
 
 
571 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  42.07 
 
 
527 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 
457 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  31.19 
 
 
577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 
525 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  38.94 
 
 
466 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  34.07 
 
 
521 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.74 
 
 
497 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.97 
 
 
468 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.5 
 
 
526 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  40.98 
 
 
625 aa  243  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
497 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  34.15 
 
 
545 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 
456 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  30.64 
 
 
529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  35.1 
 
 
552 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.39 
 
 
516 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.39 
 
 
516 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 
513 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.66 
 
 
465 aa  230  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  37.6 
 
 
451 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 
483 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34 
 
 
500 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  38.53 
 
 
472 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 
455 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 
497 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.75 
 
 
460 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  36.86 
 
 
455 aa  227  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.26 
 
 
482 aa  226  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.26 
 
 
482 aa  226  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.33 
 
 
439 aa  226  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  35.33 
 
 
439 aa  226  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.84 
 
 
438 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  31.54 
 
 
488 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  31.54 
 
 
488 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  31.54 
 
 
488 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  31.49 
 
 
490 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  32.1 
 
 
491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  32.09 
 
 
490 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  30.31 
 
 
513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  32.41 
 
 
488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  32.68 
 
 
545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 
487 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  31.22 
 
 
506 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.74 
 
 
510 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  29.24 
 
 
505 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 
523 aa  218  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  27.86 
 
 
489 aa  217  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.24 
 
 
510 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 
432 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  31.77 
 
 
410 aa  213  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  30.13 
 
 
509 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
523 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 
509 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>