More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1715 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  100 
 
 
500 aa  1036    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  41.32 
 
 
581 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  49.61 
 
 
467 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  43.15 
 
 
683 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  41.99 
 
 
715 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  40.65 
 
 
504 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  41.15 
 
 
527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.62 
 
 
568 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.65 
 
 
526 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  42.42 
 
 
672 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  41.25 
 
 
629 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  39.24 
 
 
540 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.49 
 
 
468 aa  294  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  40.05 
 
 
491 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 
460 aa  289  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.94 
 
 
457 aa  289  9e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  33.4 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  39.23 
 
 
455 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  43.07 
 
 
377 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  40.43 
 
 
504 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  34.08 
 
 
488 aa  282  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  38.86 
 
 
451 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  37.47 
 
 
526 aa  280  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.9 
 
 
465 aa  280  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  35.93 
 
 
502 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.9 
 
 
456 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  39.52 
 
 
538 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  38.8 
 
 
529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  40.7 
 
 
422 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  36.79 
 
 
546 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.26 
 
 
537 aa  274  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  38.73 
 
 
537 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  37.03 
 
 
455 aa  273  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  36.06 
 
 
466 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  39.04 
 
 
537 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  35 
 
 
472 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.47 
 
 
627 aa  269  7e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  33.4 
 
 
512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 
500 aa  267  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  37.02 
 
 
509 aa  266  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
502 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  37.11 
 
 
489 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  33.13 
 
 
502 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  37.43 
 
 
577 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.68 
 
 
512 aa  263  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 
509 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  35.9 
 
 
571 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  35.89 
 
 
650 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  33.55 
 
 
513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
513 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  33.55 
 
 
514 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  34.58 
 
 
525 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
513 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.21 
 
 
517 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.54 
 
 
509 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 
502 aa  256  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  33.48 
 
 
513 aa  256  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.66 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.66 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.97 
 
 
508 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  34.86 
 
 
529 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  40.71 
 
 
625 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.88 
 
 
438 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 
599 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.08 
 
 
439 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  37.08 
 
 
439 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  36.62 
 
 
498 aa  246  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  33.92 
 
 
640 aa  246  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  38.02 
 
 
550 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 
552 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  36.21 
 
 
474 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.56 
 
 
516 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.56 
 
 
516 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  37.92 
 
 
483 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  35.91 
 
 
545 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.78 
 
 
464 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  36.36 
 
 
475 aa  236  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  34.36 
 
 
460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  35.57 
 
 
462 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.99 
 
 
510 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 
472 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  36.22 
 
 
475 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  35.47 
 
 
478 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 
545 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  36.32 
 
 
477 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  34.75 
 
 
507 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  34.99 
 
 
509 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 
486 aa  230  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  35.94 
 
 
410 aa  230  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  34.92 
 
 
509 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 
507 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  34.48 
 
 
507 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.52 
 
 
494 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  38.1 
 
 
518 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  34.56 
 
 
473 aa  228  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.73 
 
 
510 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  34.5 
 
 
505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  36.25 
 
 
513 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  34.66 
 
 
490 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  35.39 
 
 
471 aa  226  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>