More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6283 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  71.46 
 
 
521 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  71.46 
 
 
523 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  71.26 
 
 
523 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  71.46 
 
 
521 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5181  RND family efflux transporter MFP subunit  77.51 
 
 
505 aa  774    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  71.46 
 
 
523 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  71.46 
 
 
521 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  77.91 
 
 
507 aa  795    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  82.61 
 
 
506 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  71.46 
 
 
521 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  77.51 
 
 
507 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  77.51 
 
 
507 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
509 aa  1027    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  93.52 
 
 
509 aa  926    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.19 
 
 
500 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  44.28 
 
 
545 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  46.38 
 
 
490 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  44.64 
 
 
513 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  42.28 
 
 
552 aa  360  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  42.52 
 
 
545 aa  359  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  43.36 
 
 
497 aa  352  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  40.24 
 
 
542 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.12 
 
 
510 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  39.61 
 
 
513 aa  346  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.36 
 
 
516 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.36 
 
 
516 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  38.34 
 
 
521 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  40.84 
 
 
523 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  42.61 
 
 
491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.81 
 
 
510 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  38.95 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.44 
 
 
497 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  40.57 
 
 
488 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  40.57 
 
 
488 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  40.57 
 
 
488 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.5 
 
 
497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  38.29 
 
 
483 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  47.92 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  45.66 
 
 
410 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  38.72 
 
 
486 aa  325  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.55 
 
 
507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  45.28 
 
 
417 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  39.43 
 
 
490 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  39.69 
 
 
487 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.92 
 
 
497 aa  316  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  41.12 
 
 
401 aa  296  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820375  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0655  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  37.77 
 
 
407 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.419638  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00535  copper/silver efflux system, membrane fusion protein  37.53 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3055  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.53 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0621  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  37.53 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000664889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0592  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  38.77 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.50273  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3072  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  37.53 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00524  hypothetical protein  37.53 
 
 
407 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0592  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  37.53 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00207274  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  32.99 
 
 
672 aa  266  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0468  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  38.38 
 
 
375 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  34.19 
 
 
491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  32.73 
 
 
629 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0261  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  33.5 
 
 
430 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4299  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  33.5 
 
 
430 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.6 
 
 
512 aa  240  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.99 
 
 
517 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3423  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  34.22 
 
 
430 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  30.42 
 
 
577 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  32.75 
 
 
502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  28.96 
 
 
489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  33.4 
 
 
509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  31.27 
 
 
540 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  34.92 
 
 
500 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  34.53 
 
 
455 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  30.68 
 
 
504 aa  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  28.77 
 
 
571 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  31.43 
 
 
525 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 
538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  33.17 
 
 
581 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  30.1 
 
 
537 aa  210  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 
537 aa  207  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  31.55 
 
 
422 aa  207  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 
488 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  31.16 
 
 
467 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  29.01 
 
 
546 aa  203  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  32.12 
 
 
529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.01 
 
 
482 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.01 
 
 
482 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.03 
 
 
439 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  36.03 
 
 
439 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.76 
 
 
438 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  34.65 
 
 
472 aa  193  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 
502 aa  193  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  29.51 
 
 
537 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.94 
 
 
457 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  30.38 
 
 
527 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 
715 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  32.96 
 
 
473 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
568 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 
627 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 
451 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  32.49 
 
 
526 aa  186  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  31.22 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 
502 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>