More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2893 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.14 
 
 
497 aa  673    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
507 aa  1029    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.72 
 
 
497 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.19 
 
 
497 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  52.36 
 
 
483 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  52.88 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820375  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  37.35 
 
 
505 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  37.52 
 
 
521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  39.79 
 
 
545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  39.55 
 
 
545 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  40.08 
 
 
523 aa  323  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  37.45 
 
 
513 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  42.58 
 
 
513 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  39.92 
 
 
552 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  36.77 
 
 
509 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 
516 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 
516 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  37.8 
 
 
509 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  37.53 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  40.54 
 
 
490 aa  312  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  36.59 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  36.59 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.26 
 
 
500 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  38.69 
 
 
542 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  36.79 
 
 
507 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5181  RND family efflux transporter MFP subunit  36.96 
 
 
505 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 
506 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.27 
 
 
510 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.83 
 
 
510 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  42.45 
 
 
410 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  36.8 
 
 
523 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  36.22 
 
 
523 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  39.92 
 
 
497 aa  297  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  36.02 
 
 
523 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 
521 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 
521 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 
521 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 
521 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  42.42 
 
 
408 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  38.51 
 
 
490 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  37.81 
 
 
491 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  36.97 
 
 
487 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 
488 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 
488 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 
488 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  40.62 
 
 
417 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  32.06 
 
 
629 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00535  copper/silver efflux system, membrane fusion protein  37.5 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3055  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0621  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  37.5 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000664889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3072  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  37.5 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00524  hypothetical protein  37.5 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0592  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  38 
 
 
407 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.50273  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0655  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  37.5 
 
 
407 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.419638  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0592  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  37.25 
 
 
407 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00207274  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4299  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  35.77 
 
 
430 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0261  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  35.52 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3423  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  35.52 
 
 
430 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0468  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  38.94 
 
 
375 aa  236  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.75 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  31.52 
 
 
672 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.47 
 
 
512 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  31.91 
 
 
491 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  31.01 
 
 
489 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  32.37 
 
 
577 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  32.81 
 
 
571 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  34.99 
 
 
500 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  29.96 
 
 
546 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 
538 aa  213  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  37.47 
 
 
439 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.47 
 
 
439 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  29.79 
 
 
509 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  35.73 
 
 
467 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 
537 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  34 
 
 
422 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 
525 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
537 aa  206  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  30.54 
 
 
529 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  29 
 
 
504 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.38 
 
 
482 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.38 
 
 
482 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  33.08 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.77 
 
 
627 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.98 
 
 
438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 
488 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 
502 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  29.68 
 
 
540 aa  193  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  33.84 
 
 
526 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  31.89 
 
 
478 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 
581 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  30.13 
 
 
537 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  34.82 
 
 
640 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  30.97 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 
683 aa  183  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.79 
 
 
486 aa  183  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 
494 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  31.43 
 
 
550 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.25 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  31.78 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>