More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2394 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  100 
 
 
410 aa  811    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  78.35 
 
 
408 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  61.36 
 
 
513 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  55.81 
 
 
490 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  55.94 
 
 
417 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  52.78 
 
 
486 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  53.47 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  50.25 
 
 
491 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  50.5 
 
 
488 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  50.5 
 
 
488 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  50.5 
 
 
488 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  49.87 
 
 
490 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  49.11 
 
 
487 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  51.23 
 
 
523 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  49.32 
 
 
552 aa  335  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  47.95 
 
 
545 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  47.14 
 
 
545 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  47.38 
 
 
509 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  47.11 
 
 
509 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3344  RND family efflux transporter MFP subunit  47.38 
 
 
506 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 
507 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  44.44 
 
 
507 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5181  RND family efflux transporter MFP subunit  46.83 
 
 
505 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.22 
 
 
516 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.22 
 
 
516 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  46.3 
 
 
542 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  43.96 
 
 
507 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  41.94 
 
 
521 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.26 
 
 
497 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  46.74 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820375  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.57 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  43.82 
 
 
483 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  46.47 
 
 
523 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  46.2 
 
 
523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 
521 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 
521 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 
521 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  46.11 
 
 
521 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  42.86 
 
 
505 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.71 
 
 
497 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.59 
 
 
507 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0592  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  39.59 
 
 
407 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00207274  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.9 
 
 
500 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  45.48 
 
 
513 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00535  copper/silver efflux system, membrane fusion protein  39.33 
 
 
407 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3055  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.33 
 
 
407 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0621  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  39.33 
 
 
407 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000664889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3072  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  39.33 
 
 
407 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00524  hypothetical protein  39.33 
 
 
407 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0655  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  39.07 
 
 
407 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.419638  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0592  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  39.07 
 
 
407 aa  292  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.50273  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3423  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  38.48 
 
 
430 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0261  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  38.29 
 
 
430 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4299  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  38.29 
 
 
430 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.66 
 
 
510 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.11 
 
 
510 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0468  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  40.62 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  35.48 
 
 
672 aa  243  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  38.07 
 
 
577 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  37.4 
 
 
629 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  35.55 
 
 
571 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  36.72 
 
 
489 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  34.52 
 
 
491 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  35.94 
 
 
500 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  38.84 
 
 
509 aa  226  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  33 
 
 
467 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  35.62 
 
 
529 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 
502 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.99 
 
 
486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.6 
 
 
438 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  36.21 
 
 
439 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.21 
 
 
439 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.6 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.6 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  36.13 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.34 
 
 
508 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  31.77 
 
 
504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  34.08 
 
 
537 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  33.59 
 
 
455 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  33.25 
 
 
581 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  32.41 
 
 
538 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 
498 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.16 
 
 
537 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 
504 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.3 
 
 
512 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  32.53 
 
 
546 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 
525 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.39 
 
 
509 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.44 
 
 
494 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  32.13 
 
 
537 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.97 
 
 
568 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 
488 aa  203  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.92 
 
 
517 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  33 
 
 
540 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  34.41 
 
 
550 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  34.64 
 
 
473 aa  199  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  33.42 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  35.58 
 
 
451 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  32.08 
 
 
468 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>