More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4263 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
504 aa  1018    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  65.84 
 
 
527 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.54 
 
 
526 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.58 
 
 
568 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  40.08 
 
 
500 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 
581 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.05 
 
 
460 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  42.61 
 
 
537 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  37.69 
 
 
466 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  37.33 
 
 
468 aa  273  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  43.07 
 
 
377 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  41.43 
 
 
504 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  35.39 
 
 
472 aa  270  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  35.24 
 
 
526 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.81 
 
 
627 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  36.97 
 
 
540 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  39.95 
 
 
422 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.77 
 
 
457 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 
455 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 
502 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  38.73 
 
 
451 aa  259  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 
502 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  32.19 
 
 
500 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 
465 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.23 
 
 
456 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  32.57 
 
 
472 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  34.54 
 
 
537 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  38.25 
 
 
538 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 
683 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  36.12 
 
 
546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.82 
 
 
512 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.7 
 
 
537 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  40.92 
 
 
625 aa  247  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  37.95 
 
 
467 aa  246  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 
529 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 
715 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.53 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  32.26 
 
 
650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 
509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  31.6 
 
 
640 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  32.55 
 
 
599 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 
513 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 
517 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  32.03 
 
 
513 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 
514 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 
513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  31.6 
 
 
513 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 
512 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  38.12 
 
 
550 aa  238  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  35.13 
 
 
629 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  31.86 
 
 
502 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.26 
 
 
509 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.33 
 
 
486 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  36.19 
 
 
491 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  33.42 
 
 
529 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  37.82 
 
 
498 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 
508 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  33.58 
 
 
577 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.98 
 
 
494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  36.54 
 
 
490 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1779  secretion protein HlyD  32.77 
 
 
427 aa  220  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0975048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  39.04 
 
 
473 aa  219  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  33.16 
 
 
672 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  33.5 
 
 
571 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  32.34 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 
705 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  32.94 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.42 
 
 
482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  35.08 
 
 
410 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.42 
 
 
482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  37.28 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.19 
 
 
438 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  34.45 
 
 
478 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  34.14 
 
 
474 aa  210  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.45 
 
 
464 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 
525 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.93 
 
 
671 aa  207  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  31.58 
 
 
488 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  34.53 
 
 
439 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.53 
 
 
439 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  32.35 
 
 
561 aa  206  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  33.25 
 
 
489 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  36.98 
 
 
473 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 
497 aa  204  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  35.8 
 
 
475 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.83 
 
 
497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  34.63 
 
 
475 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  35.39 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 
455 aa  200  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.47 
 
 
607 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  33.76 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 
523 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 
472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 
627 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  35.15 
 
 
408 aa  196  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 
497 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  35.85 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  37.53 
 
 
737 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  27.46 
 
 
404 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  34.44 
 
 
491 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>