More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6879 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  73.77 
 
 		 627 aa  953    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 607 aa  1255    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.99 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  48.9 
 
 		 404 aa  332  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  36.56 
 
 		 404 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  28.97 
 
 		 578 aa  242  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 451 aa  236  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.74 
 
 		 460 aa  231  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 		 455 aa  220  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.58 
 
 		 468 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  28.41 
 
 		 561 aa  216  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  34.29 
 
 		 466 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  32.89 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.01 
 
 		 465 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.01 
 
 		 456 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 527 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  33.51 
 
 		 526 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  31.47 
 
 		 504 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  30.34 
 
 		 500 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 500 aa  193  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.9 
 
 		 457 aa  193  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 		 502 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  33.06 
 
 		 472 aa  193  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 502 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 512 aa  190  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  31.98 
 
 		 650 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6878  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.79 
 
 		 526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 599 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 		 513 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 514 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.3 
 
 		 627 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  31.13 
 
 		 513 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.05 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.05 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6823  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 		 485 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1502  component of copper transport system  29.55 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000118001  normal  0.0300718 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.86 
 
 		 438 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  28.95 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 705 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.54 
 
 		 538 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 		 568 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.43 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.24 
 
 		 510 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1779  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 427 aa  169  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0975048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  29.09 
 
 		 537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  31.77 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  30.35 
 
 		 546 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  30.56 
 
 		 629 aa  167  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.4 
 
 		 537 aa  166  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  29.4 
 
 		 640 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 683 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 671 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3384  Fis family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  30.1 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  30.64 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 502 aa  160  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  30.73 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  30.5 
 
 		 542 aa  157  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  31.02 
 
 		 417 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  32.08 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  31.23 
 
 		 491 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  28.84 
 
 		 537 aa  154  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0195173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  29.95 
 
 		 505 aa  153  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 497 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 552 aa  153  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  29.56 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  30.93 
 
 		 737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 715 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  27.63 
 
 		 467 aa  148  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  28.77 
 
 		 540 aa  147  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  29.09 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 455 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  28.8 
 
 		 422 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  26.22 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  29.71 
 
 		 521 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  30.63 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  33.45 
 
 		 625 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  29.33 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  28.35 
 
 		 509 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  25.8 
 
 		 571 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.61 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.06 
 
 		 497 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  27.25 
 
 		 529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>