More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1985 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 429 aa  832    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  32.01 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 		 421 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.57 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.71 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.44 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  29.16 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  30.26 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  29.04 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  28.02 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.91 
 
 		 500 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.37 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 479 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  28.15 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.4 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.93 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  33.7 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  28.4 
 
 		 370 aa  106  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  28.4 
 
 		 370 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  29.13 
 
 		 371 aa  106  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  28.4 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  29.13 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  29.13 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.94 
 
 		 500 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  25.06 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  29.13 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  29.1 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.23 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  29.13 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  29.13 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  29.13 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.27 
 
 		 607 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  29.13 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  27.11 
 
 		 461 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  27.92 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  26.79 
 
 		 348 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 361 aa  99.8  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  28.33 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  28.54 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  24.37 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.67 
 
 		 407 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.89 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.02 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  26.89 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  26.89 
 
 		 372 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 490 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  24.88 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  26.89 
 
 		 372 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 		 487 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  26.41 
 
 		 372 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.09 
 
 		 467 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  25.61 
 
 		 456 aa  96.3  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 		 487 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  23.28 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  29.43 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  27.08 
 
 		 489 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  34.2 
 
 		 509 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  30.46 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  28.35 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  32.58 
 
 		 340 aa  93.6  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.22 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.4 
 
 		 329 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 395 aa  93.2  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  31.75 
 
 		 363 aa  92.8  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  27.79 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.77 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  25.51 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.71 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.28 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0801  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.81 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  27.95 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.76 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.88 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>