More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3303 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
418 aa  823    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  38.27 
 
 
381 aa  196  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  34.5 
 
 
389 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 
390 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.41 
 
 
347 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  34.58 
 
 
389 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 
390 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  32.06 
 
 
396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.02 
 
 
384 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  32.07 
 
 
396 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  35.09 
 
 
383 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  33.94 
 
 
383 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 
397 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  32.82 
 
 
383 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  32.82 
 
 
383 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  27.4 
 
 
381 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  31.49 
 
 
398 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  32.57 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 
398 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  31.31 
 
 
383 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  28.91 
 
 
406 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 
378 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 
383 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 
397 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.47 
 
 
396 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 
357 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
396 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.63 
 
 
404 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.13 
 
 
360 aa  97.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  29.53 
 
 
367 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.53 
 
 
367 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  26.79 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 
470 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  29.55 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  28.29 
 
 
475 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 
475 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  29.82 
 
 
281 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 
465 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
366 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  30.72 
 
 
345 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.77 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  29.82 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  29.4 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  29.55 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 
356 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.72 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  32.38 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  27 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  26.45 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.63 
 
 
372 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  27.02 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  27.02 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  27.02 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.92 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  26.4 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  26.4 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  26.37 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  28.74 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  26.4 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  33.19 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.79 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  27.12 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.71 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  26.77 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  30.36 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  30.18 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  28.57 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  24.21 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28.57 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.71 
 
 
285 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.57 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  28.57 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.48 
 
 
372 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  28.57 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  26.71 
 
 
285 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.57 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.57 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  29.83 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  26.92 
 
 
367 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  28.14 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  28.29 
 
 
331 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  30.74 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  27.05 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.78 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  32.37 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  25.78 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>