More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0913 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  687    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  98.82 
 
 
338 aa  681    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  36.88 
 
 
366 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  37.38 
 
 
340 aa  195  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  38.54 
 
 
343 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  36.05 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  31.54 
 
 
365 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 
360 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.65 
 
 
368 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  28.49 
 
 
360 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  29.81 
 
 
367 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.15 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  29.17 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  29 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  27.95 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  28.96 
 
 
368 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  27.85 
 
 
360 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 
416 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  25.8 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 
351 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  29.71 
 
 
366 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
404 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 
389 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.89 
 
 
357 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 
361 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 
366 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 
366 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 
409 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 
366 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  28.34 
 
 
367 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 
366 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 
414 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
340 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  29.29 
 
 
403 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  31.31 
 
 
367 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.975013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 
349 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.04 
 
 
400 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0641  RND family efflux transporter MFP subunit  31.85 
 
 
360 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0664  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.85 
 
 
360 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.66 
 
 
375 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 
429 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  27.61 
 
 
373 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 
379 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 
369 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0668  RND family efflux transporter MFP subunit  31.85 
 
 
360 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  28.69 
 
 
523 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 
390 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 
362 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 
361 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 
419 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 
381 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 
395 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 
455 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  25.87 
 
 
353 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  28.04 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.33 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.33 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.33 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  27.95 
 
 
403 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.33 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.33 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.33 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.51 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4143  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.478516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  26.79 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  28.49 
 
 
471 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.33 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  25.58 
 
 
394 aa  97.1  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3695  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 
419 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 
505 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  27.36 
 
 
365 aa  96.3  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  26.19 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  25.87 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  26.69 
 
 
407 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  26.85 
 
 
359 aa  96.3  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  24.77 
 
 
419 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  28.22 
 
 
397 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  25.3 
 
 
478 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.05 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 
472 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 
478 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 
405 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  28.52 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  27.02 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>