More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1133 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
391 aa  776    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0573  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.9 
 
 
389 aa  249  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000216198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 
394 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.61 
 
 
426 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.96 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.67 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.22 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  24.12 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  30.29 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  24.7 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  24.72 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.67 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26.38 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  26.67 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 
365 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  29.45 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.43 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  22.98 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  26.21 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.23 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.89 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  24.09 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  26.52 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  25.38 
 
 
407 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1962  RND family efflux transporter MFP subunit  21.13 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  28.62 
 
 
368 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  24.66 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  25.1 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  25.21 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.04 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.25 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.36 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  27.65 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  28.23 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  24.91 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  27.57 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  20.64 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  29.52 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  23.17 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  26.07 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.51 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  23.96 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  30.67 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 
426 aa  67  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  24.53 
 
 
444 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  31.64 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.14 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  29.28 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.08 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  24.36 
 
 
354 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  23.91 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  25.67 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  22.84 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.94 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  22.31 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.5 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  27.75 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  27.03 
 
 
368 aa  64.3  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  28.72 
 
 
334 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  28.49 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  28.81 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  24.8 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>