More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6554 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  100 
 
 		 351 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  69.55 
 
 		 343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  69.55 
 
 		 343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  69.55 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  69.23 
 
 		 343 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  69.23 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  69.55 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  69.23 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  69.55 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  39.61 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  39.61 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  39.61 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  35.16 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  39.09 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  36.1 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  37.25 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  35.78 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  35.78 
 
 		 349 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  35.41 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  35.78 
 
 		 349 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  35.78 
 
 		 349 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  35.78 
 
 		 349 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  35.38 
 
 		 349 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0241  multidrug resistance protein MdtN  35.8 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  35.44 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  33.83 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  32.21 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  31.6 
 
 		 331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  33.14 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  35.2 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  32.08 
 
 		 378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  33.14 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  34.55 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  32.96 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  31.4 
 
 		 443 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  35.42 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  31.49 
 
 		 372 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  30.41 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  30.98 
 
 		 413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  30.81 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  31 
 
 		 368 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  33.44 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  32.57 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  32.95 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  31.49 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  34.38 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  31.72 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  31.21 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  31.52 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  33.05 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  31.89 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  35.28 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.43 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  30.43 
 
 		 285 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  30.43 
 
 		 285 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  30.43 
 
 		 285 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  30.43 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  31.21 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  30.43 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.12 
 
 		 285 aa  129  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  32 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  30.81 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  31.52 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  30.32 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.12 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  30.12 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  30.51 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.76 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  30.75 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  32.08 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  31.89 
 
 		 364 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  30.88 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  32.08 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  32.78 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  31.67 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  32.08 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  32.12 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  32.29 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  30.75 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  33.76 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  31.68 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  33.76 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  31.88 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  29.64 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 		 368 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  31.54 
 
 		 456 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  32.91 
 
 		 383 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  30.46 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  32.92 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  31.76 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  31.45 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  32.04 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  32.59 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  33.22 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  33 
 
 		 406 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  28.49 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>