More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5998 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 394 aa  789    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  84.3 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  56.79 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  56.36 
 
 		 413 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  59.13 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  55.49 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  54.58 
 
 		 352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  46.18 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  54.25 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  46.09 
 
 		 380 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  48.07 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  44.56 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  47.77 
 
 		 342 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  46.74 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  49.85 
 
 		 353 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  46.75 
 
 		 358 aa  279  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  50.29 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  47.18 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  45.95 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  45.03 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  50.29 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  47.15 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  44.15 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.34 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  48.4 
 
 		 356 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  49.18 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  43.75 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  43.6 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  44.83 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  43.43 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  44.55 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  46.77 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  48.57 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  45.57 
 
 		 381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  42.9 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  51.48 
 
 		 344 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  50.65 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  42.05 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  46.63 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  46.33 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  47.56 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40.98 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  43.11 
 
 		 422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  44.96 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  49.01 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  42.82 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  41.59 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  42.77 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  46.27 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 364 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  41 
 
 		 355 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  44.93 
 
 		 400 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  42.9 
 
 		 404 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  43.08 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  42.47 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  45.14 
 
 		 374 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  42.9 
 
 		 411 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  45.14 
 
 		 374 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 411 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  45.14 
 
 		 374 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  42.94 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  42.45 
 
 		 363 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  42.45 
 
 		 363 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  43.08 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  41.04 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  41.43 
 
 		 350 aa  236  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  43.9 
 
 		 374 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.06 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  44.81 
 
 		 374 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  44.81 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  44.81 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  51.97 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  39.94 
 
 		 456 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  37.15 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  42.77 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.53 
 
 		 351 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  39.82 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  40.66 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  41.3 
 
 		 408 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  41.14 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 352 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  40.72 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  39.55 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  40.84 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  44.16 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>