More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0535 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  99.71 
 
 		 349 aa  706    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  100 
 
 		 349 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  100 
 
 		 349 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  50.86 
 
 		 350 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  51.16 
 
 		 349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  50 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  49.71 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  46.99 
 
 		 349 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  47.66 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  47.66 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  48.99 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  48.25 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  47.66 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  47.66 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  47.66 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0241  multidrug resistance protein MdtN  42.86 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  41.67 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  37.89 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  41.35 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  41.35 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  41.35 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  41.35 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  41.35 
 
 		 343 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  41.35 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  41.03 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  32.36 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  28.53 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  27.51 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  30.38 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  30.75 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  28.15 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  29.9 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  29.25 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  29.03 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  28.07 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  32.08 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  27.08 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  29.97 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  28.02 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  27.73 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  28.92 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  25.7 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.97 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  25.7 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  31.63 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.49 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  30.5 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  27.62 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  25.93 
 
 		 288 aa  116  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  28.45 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.39 
 
 		 285 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  30.97 
 
 		 475 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 475 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 		 413 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  28.18 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  25.39 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.08 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.08 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  29.43 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  29.13 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  27.76 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  25.08 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  29.48 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  29.43 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  25.07 
 
 		 287 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  25.07 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  25.37 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  28.7 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  25.07 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.6 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  26.27 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  26.51 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  30.24 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>