More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5245 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 333 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  64.26 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  63.53 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  51.65 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  52.41 
 
 		 475 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  52.41 
 
 		 475 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  52.41 
 
 		 470 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  52.96 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  51.51 
 
 		 460 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  51.51 
 
 		 460 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  51.81 
 
 		 468 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  48.35 
 
 		 395 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  48.35 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  48.35 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  48.35 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  48.35 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  48.35 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  48.35 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.57 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.6 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 443 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  35.33 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  33.83 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 366 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  34.63 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  40.73 
 
 		 365 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  34.51 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  39.14 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  37.2 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 356 aa  195  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 383 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  36.01 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 351 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.84 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 		 400 aa  188  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  38.44 
 
 		 358 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  37.42 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  37.46 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  38.34 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.04 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  34.65 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  37.72 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  34.35 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  39.76 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  36.81 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  37.69 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  32.52 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  36.56 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  32.27 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  35.62 
 
 		 389 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  34.94 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  33.73 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  33.54 
 
 		 456 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  35.76 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  33.02 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  34.72 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  32.84 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  32.84 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  38.24 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  34.35 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  34.47 
 
 		 411 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  35.65 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  35.35 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  33.85 
 
 		 419 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  34.85 
 
 		 414 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  32.53 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  34.83 
 
 		 393 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>