More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3393 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
350 aa  708    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  82.13 
 
 
349 aa  597  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  81.84 
 
 
349 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  67.06 
 
 
354 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  59.64 
 
 
355 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  54.68 
 
 
385 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  55.76 
 
 
380 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  54.38 
 
 
387 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  54.82 
 
 
377 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  52.27 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  53.78 
 
 
377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  53.17 
 
 
358 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  52.35 
 
 
375 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  51.81 
 
 
386 aa  315  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  49.1 
 
 
348 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  49.55 
 
 
385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  52.73 
 
 
397 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  47.48 
 
 
463 aa  298  8e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  45.67 
 
 
467 aa  293  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  52.98 
 
 
360 aa  289  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  51.33 
 
 
358 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  46.41 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  41.79 
 
 
333 aa  268  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.39 
 
 
383 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  39.48 
 
 
413 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.02 
 
 
375 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41 
 
 
342 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.8 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.36 
 
 
364 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.49 
 
 
385 aa  209  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 
380 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 
396 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 
365 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 
344 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  38.01 
 
 
380 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.39 
 
 
373 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 
351 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  39.5 
 
 
372 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 
351 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 
351 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.76 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  39.56 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  38.34 
 
 
356 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  35.61 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  40 
 
 
346 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  37.89 
 
 
358 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 
358 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.01 
 
 
344 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 
353 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  34.94 
 
 
422 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.54 
 
 
377 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.21 
 
 
368 aa  190  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.72 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 
400 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 
333 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 
352 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 
406 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 
371 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  36.86 
 
 
372 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.39 
 
 
355 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 
351 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 
390 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  36.63 
 
 
373 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.29 
 
 
363 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  39.42 
 
 
391 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 
382 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 
387 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 
394 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  35.67 
 
 
366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  39.59 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  37.81 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  35.02 
 
 
381 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.47 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  35.95 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  34.87 
 
 
359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 
360 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 
367 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  40.17 
 
 
381 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 
374 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.77 
 
 
375 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 
358 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  39.24 
 
 
374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 
374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.09 
 
 
411 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  35.12 
 
 
347 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.92 
 
 
393 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  37.73 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>