More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2675 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 360 aa  717    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  60.87 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  54.97 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  54.05 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  50.59 
 
 		 349 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  50.3 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  53.17 
 
 		 350 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  48.36 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  48.96 
 
 		 377 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  46.92 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  45.58 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  45.95 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  49.85 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  43.57 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  48.4 
 
 		 375 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  49.39 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  50.45 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  46.04 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  44.28 
 
 		 467 aa  266  5e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  43.67 
 
 		 463 aa  260  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 444 aa  253  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  42.15 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  35.8 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.11 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  34.93 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  34.93 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  34.93 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  34.65 
 
 		 352 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.38 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.68 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.99 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.01 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  38.23 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 372 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  37.83 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  37.43 
 
 		 413 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.62 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  39.48 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  35.65 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.04 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  35.99 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  36.04 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  36.59 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  32.96 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.86 
 
 		 385 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  35.48 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.5 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  37.43 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 401 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.56 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  32.93 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  35.8 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  39.19 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.8 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  36.86 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.5 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  36.99 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  34.6 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  34.35 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  38.61 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  35.57 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 		 363 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  29.85 
 
 		 349 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.36 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  36.6 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  36.77 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  37.38 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  34.44 
 
 		 411 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  35.28 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  34.04 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.94 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 402 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  34.82 
 
 		 373 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 		 393 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  35.26 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>