More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0859 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 358 aa  707    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  56.02 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  52.05 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  53.17 
 
 		 350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  48.87 
 
 		 377 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  50.59 
 
 		 385 aa  315  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  47.45 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  48.88 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  50.3 
 
 		 349 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  50.3 
 
 		 349 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  48.17 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  50.29 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  52.98 
 
 		 375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  49.54 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  51.61 
 
 		 397 aa  298  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  48.2 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  48.16 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  45.64 
 
 		 463 aa  295  7e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  47.25 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  48.73 
 
 		 377 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  49.69 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  48.35 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  38.64 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  41.3 
 
 		 414 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.45 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  40.65 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  43.57 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  43.23 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  43.05 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  43.77 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.99 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  40.59 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  42.44 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.24 
 
 		 355 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  42.58 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  44.34 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.26 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.14 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.44 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  37.83 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  39.09 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  39.36 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  43.08 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  39.11 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  38.15 
 
 		 392 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  42.16 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  41.74 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  40.99 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  39.42 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  41.09 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 352 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.99 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 		 344 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  39.14 
 
 		 400 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  42.12 
 
 		 400 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  38.95 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  39.44 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  40.46 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  35.36 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  40.3 
 
 		 373 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  38.65 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  38.69 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  37.82 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.82 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  42.53 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.17 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 352 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 352 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  42.21 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.36 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40.47 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  33.99 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.41 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  37.99 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  36.98 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  38.71 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>