More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0508 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 444 aa  897    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  72.78 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  71.2 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  45.31 
 
 		 385 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  43.85 
 
 		 387 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  46.99 
 
 		 360 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  45.25 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  47.15 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  41.6 
 
 		 385 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  44.3 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  50.31 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  46.22 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  46.41 
 
 		 350 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  43.11 
 
 		 349 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  43.11 
 
 		 349 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  45.25 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  43.28 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  49.7 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  44.94 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  42.04 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  43.87 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  38.53 
 
 		 333 aa  226  9e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  38.2 
 
 		 390 aa  206  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  38.53 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.36 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 414 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  34.09 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  39.13 
 
 		 346 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  37.7 
 
 		 342 aa  189  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  38.6 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  36.96 
 
 		 373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  34.15 
 
 		 375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  36.43 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.73 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  37.27 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  36.53 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.16 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  31.99 
 
 		 354 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  32.09 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  34.86 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.28 
 
 		 364 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 		 394 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  32.16 
 
 		 372 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.59 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  34.86 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  36.25 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  33.15 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  35.89 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  34.45 
 
 		 351 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 		 353 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 422 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  34.07 
 
 		 372 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  35.75 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  36.14 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  32.45 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 		 349 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  32.42 
 
 		 373 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  37.94 
 
 		 394 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  34.52 
 
 		 363 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  34.11 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.67 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  33.88 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  33.64 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  35.47 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  34.63 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  34.48 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  34.33 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  32.8 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2416  secretion protein HlyD family protein  32.21 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  31.66 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  34.8 
 
 		 358 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  33.62 
 
 		 352 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 		 344 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  33.62 
 
 		 352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  33.62 
 
 		 352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  34.46 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  33.62 
 
 		 352 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.66 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  32 
 
 		 355 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  33.55 
 
 		 363 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 405 aa  163  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  33.89 
 
 		 351 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  34.17 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  31.55 
 
 		 372 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  34.37 
 
 		 350 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>