More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2360 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 344 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  55.22 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  47.04 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  41.86 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  42.25 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  46.88 
 
 		 385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  43.71 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 351 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  42.73 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  42.06 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  40.92 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  41.16 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  43.4 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  43.94 
 
 		 380 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  42.9 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  46.94 
 
 		 371 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.84 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  42.77 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  43.18 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  42.81 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.77 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  42.44 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  43.81 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  43.45 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  42.9 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  47.32 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  41.34 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  43.67 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  42.18 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  44.34 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  42.48 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  44.13 
 
 		 374 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 374 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 374 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  40.3 
 
 		 349 aa  232  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  40.3 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  42.95 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  42.9 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  42.99 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  40.68 
 
 		 414 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  43.81 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  42.23 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  42.94 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  42.56 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  44.44 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.61 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 406 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  41.38 
 
 		 411 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 		 394 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  41.72 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  41.74 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  43.77 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.19 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  43.04 
 
 		 352 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  39.35 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.96 
 
 		 374 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 374 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  43.17 
 
 		 354 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  37.95 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  40.63 
 
 		 456 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  42.09 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  43.35 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  42.26 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 		 358 aa  215  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  43.71 
 
 		 405 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  40.95 
 
 		 419 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  41.16 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  44.79 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.65 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  42.16 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  42.31 
 
 		 383 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.35 
 
 		 355 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.12 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.08 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  38.87 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 387 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>