More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3990 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
383 aa  771    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  48.39 
 
 
377 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  42.82 
 
 
383 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  42.25 
 
 
390 aa  255  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  41.51 
 
 
413 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  44.99 
 
 
371 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  45.14 
 
 
385 aa  242  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  42.2 
 
 
380 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.36 
 
 
352 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.36 
 
 
352 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  41.69 
 
 
390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.36 
 
 
352 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 
352 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  40.66 
 
 
351 aa  232  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 
351 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  40.66 
 
 
351 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  44.01 
 
 
396 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.43 
 
 
355 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.13 
 
 
344 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  41.03 
 
 
349 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  41.03 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 
380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  40.99 
 
 
375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  41.07 
 
 
348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  41.71 
 
 
394 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  42.02 
 
 
355 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 
394 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  41.39 
 
 
350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  37.54 
 
 
349 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  42.57 
 
 
355 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 
390 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  43.28 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  43.08 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 
414 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  42.31 
 
 
356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 
360 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  40.75 
 
 
350 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 
363 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
351 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  42.94 
 
 
353 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.6 
 
 
373 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 
358 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 
367 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.49 
 
 
364 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  38.04 
 
 
387 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  41.29 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  38.5 
 
 
385 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 
344 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  41.64 
 
 
354 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  38.75 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.95 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  43.65 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  39.81 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  40.25 
 
 
358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.81 
 
 
393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 
352 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.97 
 
 
364 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 
397 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  38.74 
 
 
344 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  42.67 
 
 
354 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  42.03 
 
 
353 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.64 
 
 
375 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  39.49 
 
 
381 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  40.78 
 
 
364 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 
363 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  40.78 
 
 
364 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  41.74 
 
 
367 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  41.45 
 
 
367 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  40.78 
 
 
364 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  36.99 
 
 
408 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  39.32 
 
 
358 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 
366 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 
385 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  42.98 
 
 
358 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 
377 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 
378 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.33 
 
 
372 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 
342 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  36.75 
 
 
380 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 
373 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.8 
 
 
366 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  40.97 
 
 
381 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  39.49 
 
 
372 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 
358 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  37.79 
 
 
366 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.86 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  37.42 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  41.46 
 
 
301 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.82 
 
 
365 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  39.09 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  34.93 
 
 
419 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>