More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0954 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 413 aa  817    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  82.44 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  58.59 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  65.31 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  57.26 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  56.36 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  54.19 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  54.19 
 
 		 352 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  50.3 
 
 		 358 aa  298  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  51.94 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 380 aa  295  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  48.09 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  45.35 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  50.3 
 
 		 358 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  45.48 
 
 		 380 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  46.29 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  51.76 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  47.79 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  51.74 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  46.26 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 353 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  47.18 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  50.74 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  43.56 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  49.54 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  46.55 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  45.71 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  46.36 
 
 		 373 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  46.83 
 
 		 356 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  50.74 
 
 		 367 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.75 
 
 		 414 aa  269  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  45.17 
 
 		 378 aa  266  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  45.98 
 
 		 372 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  42.38 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  47.21 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  47.21 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  47.21 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  45.27 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  50.3 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  48.09 
 
 		 346 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  46.13 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  44.57 
 
 		 365 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  40.1 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  47.84 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 390 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  41.49 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  44.06 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  44 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  46.86 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  46.86 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  46.86 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  43.03 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  40.93 
 
 		 456 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  50.31 
 
 		 354 aa  249  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  46.79 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  42.51 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.42 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  44.08 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 		 351 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 		 351 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  45.37 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  42.74 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.86 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.51 
 
 		 383 aa  245  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  46.97 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  44.77 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  42.18 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 352 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  41.59 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  44.1 
 
 		 377 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  44.18 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  41.22 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  41.82 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  43.79 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  42.9 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  46.06 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  44.19 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.55 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  41.38 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  43.26 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.2 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  43.83 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  44.48 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  45.51 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  39.05 
 
 		 368 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  43.17 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  43.83 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  43.83 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.5 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>