More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2180 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  100 
 
 		 408 aa  807    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  70.07 
 
 		 411 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  70.41 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  69.76 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  71.63 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  52.65 
 
 		 393 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  53.61 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  51.1 
 
 		 402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  51.26 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  47.48 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  46.57 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  39.9 
 
 		 411 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  49.42 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  42.59 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  42.35 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  43.62 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  39.75 
 
 		 413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  39.65 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  41.76 
 
 		 413 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  41.36 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  43.39 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  40.5 
 
 		 372 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  41.74 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.88 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.97 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.25 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.62 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 344 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  38.51 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  39.13 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  39.48 
 
 		 373 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  39.64 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  37.67 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  37.26 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.38 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  37.18 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  38.4 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  38.4 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  38.4 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  39.48 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  38.02 
 
 		 373 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.83 
 
 		 349 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  39.6 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 354 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.95 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 		 371 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.95 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40.36 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.49 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  33.53 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  33.82 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.46 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  37.35 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 363 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.17 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 363 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.76 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  39.33 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.71 
 
 		 351 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 351 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  35.23 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.76 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 352 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  37.54 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  37.17 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  37.71 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  34.15 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  39.89 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.17 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.86 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.86 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.86 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  40.47 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  36.08 
 
 		 425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  39.12 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 349 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 374 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  33.62 
 
 		 364 aa  190  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  39.76 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 366 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  36.91 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  35.65 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  33.78 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>