More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0207 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  100 
 
 		 371 aa  735    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  70.2 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  46.84 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  44.99 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  47.63 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  47.13 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  42.72 
 
 		 414 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  48.38 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.18 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  43.77 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  46.54 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  42.95 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  47.38 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  44.9 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  43.53 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  40.99 
 
 		 378 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  45.32 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  44.9 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  44.55 
 
 		 373 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  42.04 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  42.17 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  45.78 
 
 		 371 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  38.3 
 
 		 351 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 351 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  42.81 
 
 		 411 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  47.21 
 
 		 354 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  44.34 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  42.46 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  43.23 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  43.65 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.27 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.88 
 
 		 350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.94 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  43.47 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  41.58 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  37 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  40.78 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 406 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.45 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  40.63 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.1 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.49 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.61 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  43.8 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.61 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.45 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  42.39 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  40.32 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 350 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  40.13 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  40.13 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.45 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  43.52 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  43.52 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  42.98 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  41.59 
 
 		 419 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  39.81 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  41.82 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  41.04 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  44.05 
 
 		 344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  43.97 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  39.42 
 
 		 366 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  38.85 
 
 		 348 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  38.55 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  43.25 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  40.95 
 
 		 354 aa  195  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  43.04 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  41.46 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  40.85 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  39.83 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  39.64 
 
 		 387 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 		 394 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.85 
 
 		 349 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 377 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  39.57 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40.26 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>