More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3703 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 387 aa  773    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  95.35 
 
 		 385 aa  703    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  74.65 
 
 		 380 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  69.79 
 
 		 377 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  69.79 
 
 		 377 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  59.82 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  54.38 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  51.8 
 
 		 349 aa  354  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  51.5 
 
 		 349 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  52.66 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  53.94 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  58.81 
 
 		 358 aa  342  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  55.17 
 
 		 375 aa  338  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 		 385 aa  319  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  51.22 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  44.88 
 
 		 467 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  43.96 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  44.69 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  51.94 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  45.88 
 
 		 348 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  48.48 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  46.77 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  40.21 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  36.71 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  39.41 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.1 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  42.63 
 
 		 390 aa  222  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  38.04 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  39.04 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  38.17 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.09 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.92 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.53 
 
 		 366 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  39.47 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.83 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40.06 
 
 		 373 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  38.62 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  42.22 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  39.74 
 
 		 356 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  38.27 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.65 
 
 		 365 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.26 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.5 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.58 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  40 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  39.12 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  38.84 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  37.74 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  39.44 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.58 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  38.21 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.62 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.18 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  38.24 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  35.16 
 
 		 380 aa  190  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  33.91 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  38.97 
 
 		 353 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  39.27 
 
 		 401 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  37.08 
 
 		 367 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.82 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.69 
 
 		 350 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  39.58 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  36.53 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  34.93 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  37.08 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  35.9 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  38.99 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  37.08 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  37.36 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.36 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.64 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.8 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  37.36 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  37.6 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 364 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>