More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2638 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  90.71 
 
 		 377 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 377 aa  749    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  73.39 
 
 		 380 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  70.32 
 
 		 385 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  69.79 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  59.77 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  53.78 
 
 		 350 aa  355  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  51.83 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  51.52 
 
 		 349 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  60.06 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  52.62 
 
 		 355 aa  348  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  53.93 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  55.02 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  51.48 
 
 		 385 aa  335  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  47.88 
 
 		 467 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  51.94 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  45.25 
 
 		 444 aa  306  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  46.97 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  49.56 
 
 		 358 aa  302  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  47.26 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  49.22 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  38.71 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.23 
 
 		 390 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  37.2 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41.5 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  39.58 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  36.71 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.04 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  38.27 
 
 		 354 aa  205  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 380 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.81 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  40.58 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.07 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  35.07 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.5 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  40.67 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  39.09 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.64 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.45 
 
 		 377 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  38.81 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  39.62 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.87 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  39.36 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  40.73 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.81 
 
 		 348 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 363 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  41.04 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 		 372 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  34.01 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.31 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.29 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  38.94 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  38.31 
 
 		 364 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  33.92 
 
 		 347 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  36.91 
 
 		 401 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.39 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  36.95 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  38.31 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.52 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  38.31 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.69 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>