More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1332 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 342 aa  678    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  55.85 
 
 		 352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  55.18 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  48.97 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  47.34 
 
 		 413 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  53.55 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  45.24 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  49.36 
 
 		 356 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  53.87 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  49.21 
 
 		 385 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  53.87 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  53.55 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  44.22 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  46.92 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  46.99 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  46.36 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  47.28 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  50.97 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  47.13 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  46.45 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  42.77 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 		 358 aa  259  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  45.32 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  47.49 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  46.86 
 
 		 358 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 380 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  43.6 
 
 		 363 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  49.35 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  44.33 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 378 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  42.94 
 
 		 390 aa  235  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  42.44 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  43.75 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.31 
 
 		 380 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  40.36 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.65 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  40.71 
 
 		 375 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.21 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  41.82 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  40.76 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40.17 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  42.22 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  42.48 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 406 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  42.49 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.88 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  37.28 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 422 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  40.89 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  40.67 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  42.35 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 381 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  38.99 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  41.67 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  39.49 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  37.96 
 
 		 463 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  39.67 
 
 		 349 aa  212  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  39.67 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  41.64 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  41.86 
 
 		 375 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 390 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.58 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  39.24 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.13 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.61 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  39.34 
 
 		 371 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  41 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.37 
 
 		 371 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  40.84 
 
 		 373 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  40.85 
 
 		 377 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  43.05 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  39.87 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  42.14 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.03 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 397 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  39.47 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  43.79 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 402 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  39.46 
 
 		 421 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 364 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>