More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3793 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  100 
 
 		 373 aa  739    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  67.35 
 
 		 380 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  66.13 
 
 		 375 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  63.16 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  55.24 
 
 		 363 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  55.24 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  54.92 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  54.72 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  54.72 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  54.92 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  54.6 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  49.86 
 
 		 366 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  49.3 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  49.86 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  49.38 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  44.93 
 
 		 413 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  43.92 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  49.03 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  49.03 
 
 		 354 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  46.31 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  47.06 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  46.45 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  44.78 
 
 		 414 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  44.96 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  41.02 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  42.45 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  41.86 
 
 		 413 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  47.5 
 
 		 378 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.79 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  46.78 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  43.14 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.5 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.79 
 
 		 351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  43.55 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  43.53 
 
 		 350 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  46.97 
 
 		 372 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  42.98 
 
 		 402 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  41 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  42.24 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  40.63 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  43.77 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  44.54 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  46.83 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  42.81 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  41.4 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 		 351 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40 
 
 		 355 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  40.23 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 		 358 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 393 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  41.9 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  44.84 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  44.82 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  44.82 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  44.24 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41.99 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  41.85 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  44.84 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  40 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  44.93 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  44.93 
 
 		 374 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  44.93 
 
 		 374 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  43.95 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  44.63 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  44.07 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  43.22 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  42.6 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  41.61 
 
 		 355 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  43.33 
 
 		 397 aa  232  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  41.16 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  40.59 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  41.83 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  42.5 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  42.37 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  44.67 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  44.08 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  45.31 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  43.61 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  43.02 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  42.73 
 
 		 422 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  44.79 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  36.1 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  41.4 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  43.22 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 		 386 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>