More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1183 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 354 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  42.94 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  44.41 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.57 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  41.18 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  41.18 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.13 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  37.92 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 380 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  37.9 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.8 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.7 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  40.29 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 372 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  41.48 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.2 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.05 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  37.17 
 
 		 373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.68 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  39.19 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  39.69 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  39.61 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  39.61 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  39.61 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  36.98 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  39.57 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.51 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  38.29 
 
 		 374 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  38.29 
 
 		 374 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  38.29 
 
 		 374 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  38.32 
 
 		 397 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  39.75 
 
 		 341 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  36.56 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.73 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  41.79 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  37.08 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.26 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  37.93 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  37.04 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 385 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  38.15 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  37.81 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  36.93 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  38.39 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  37.3 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  34 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  37.3 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  37.36 
 
 		 422 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  37.3 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.56 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  34.39 
 
 		 467 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  37.3 
 
 		 349 aa  199  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.14 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  38.78 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.9 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  36.96 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  34.1 
 
 		 463 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  34.89 
 
 		 456 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.92 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  38.77 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  35.21 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 401 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  35.63 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  35.35 
 
 		 374 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  37.97 
 
 		 400 aa  192  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  37.73 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>