More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3484 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  100 
 
 		 354 aa  709    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  67.06 
 
 		 350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  61.56 
 
 		 349 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  61.27 
 
 		 349 aa  434  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  57.43 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  53.69 
 
 		 385 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  53.94 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  56.02 
 
 		 358 aa  338  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  52.51 
 
 		 348 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  54.3 
 
 		 377 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  53.19 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  51.96 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  53.31 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  49.42 
 
 		 385 aa  318  7.999999999999999e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  46.63 
 
 		 467 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  55.02 
 
 		 377 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  54.97 
 
 		 360 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  51.4 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  51.82 
 
 		 397 aa  302  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  45.45 
 
 		 463 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  51.98 
 
 		 358 aa  278  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  44.94 
 
 		 444 aa  262  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  40.85 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  42.76 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  42.9 
 
 		 413 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  41.52 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  42.48 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  37.2 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  41.88 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  41.29 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.13 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  40.78 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  40.58 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.6 
 
 		 375 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  40.85 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  40.45 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  40.66 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  35.63 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  38.39 
 
 		 380 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.88 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.56 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.56 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.56 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.17 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  39.69 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  40.17 
 
 		 360 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  35.88 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  37.6 
 
 		 393 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  41.92 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.71 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  40.26 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  38.97 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  37.2 
 
 		 372 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 		 400 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40.26 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  35.51 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  36.6 
 
 		 355 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 422 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  38.26 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  40.95 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.8 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  39.35 
 
 		 344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  39.87 
 
 		 391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 390 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  36.28 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.47 
 
 		 348 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  36.68 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  35.28 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  38.89 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  37.83 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  37.04 
 
 		 400 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  34.74 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  40.55 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  39.16 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.91 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>