More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6591 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 378 aa  745    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  71.39 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  59.94 
 
 		 380 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  48.66 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  47.23 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  44.59 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 		 413 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  47.21 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  46.57 
 
 		 380 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  48.44 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  46.77 
 
 		 372 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  45.63 
 
 		 375 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  46.67 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  48.31 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  47.75 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  43.55 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  48.7 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  42.44 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  46.2 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  45.76 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  47.59 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  44.24 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  41.33 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  45.25 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  48.66 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  40.99 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  41.27 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  43.28 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  49.54 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  49.54 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  49.54 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  46.65 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  46.34 
 
 		 374 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 		 374 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  46.08 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  45.04 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  45.34 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  42.77 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.58 
 
 		 355 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  41.37 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  46.13 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  41.01 
 
 		 393 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  44.84 
 
 		 377 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  44.51 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  44.51 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  44.51 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  38.84 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.83 
 
 		 375 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  44.94 
 
 		 405 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  45.48 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  43.89 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.14 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  43.85 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  43.85 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  43.85 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 352 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 352 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 352 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  42.51 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.98 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  41.23 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  41.44 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  39.09 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  39.69 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 351 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  45.79 
 
 		 397 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  45.48 
 
 		 353 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  45.18 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  38.84 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  39.05 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  44.58 
 
 		 358 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  39.06 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  44.28 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  40.64 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.76 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  42.98 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  43.11 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.34 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  41.54 
 
 		 354 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  39.53 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.85 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  42.73 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  45.4 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  42.39 
 
 		 393 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  42.55 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>