More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1815 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 390 aa  773    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  48.93 
 
 		 377 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  46.09 
 
 		 371 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  45.99 
 
 		 383 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  42.25 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  45.99 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  43.41 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  44 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  42.09 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.03 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  39.78 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  45.94 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  45.7 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  40.62 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  41.58 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.07 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.03 
 
 		 414 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.74 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.38 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  40.76 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  40.67 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.02 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  38.81 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  42.02 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.19 
 
 		 344 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 363 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  40.8 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.64 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  41.11 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  43.53 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  40.96 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.83 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.83 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  38.54 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  40.36 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  41.23 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  42.39 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  41.36 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  41.23 
 
 		 352 aa  215  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  40.57 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  42.39 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  40.57 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  41.52 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.38 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.12 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.39 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  41.56 
 
 		 354 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.24 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  37.02 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  44.94 
 
 		 353 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  38.44 
 
 		 349 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  39.56 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  41.59 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  35.69 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  39.48 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 401 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  44.12 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  42.58 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  42.58 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  42.58 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  38.07 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.92 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  42.5 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.68 
 
 		 404 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  39.19 
 
 		 400 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  43.06 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.36 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  44.13 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.58 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 		 354 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>