More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2630 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 366 aa  744    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  94.81 
 
 		 366 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  59.67 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  65.03 
 
 		 372 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  64.35 
 
 		 374 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  60.82 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  56.78 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  45.21 
 
 		 334 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  43.04 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 		 443 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  35.29 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  36.14 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  38.63 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  37.08 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  37.08 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  36.94 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  39.25 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 346 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 390 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  36.29 
 
 		 375 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.13 
 
 		 475 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  36.8 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.13 
 
 		 475 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.13 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  33.61 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  39.94 
 
 		 332 aa  209  9e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 366 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 		 460 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.38 
 
 		 390 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.88 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  35.28 
 
 		 394 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  39.16 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  36.81 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  37.2 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  36.89 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  38.83 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  37.2 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  37.2 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  37.2 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  37.2 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  37.2 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  35.59 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  37.8 
 
 		 390 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  36.89 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  38.61 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  38.63 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  37.93 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.51 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  35.31 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  37.94 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  37.89 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 		 351 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  36.02 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  34.36 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  38.16 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  38.4 
 
 		 377 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  44.78 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 		 468 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  33.14 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  44.78 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.73 
 
 		 420 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.04 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  37.04 
 
 		 406 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.24 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  36.73 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  36.08 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  36.44 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  35 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  33.03 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.42 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  37.17 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  34.68 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  37.17 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.57 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>