More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2026 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 401 aa  815    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  71.51 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  64.91 
 
 		 333 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  54.91 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  54.91 
 
 		 475 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  54.91 
 
 		 475 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  55.28 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  52.22 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  53.47 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  51.59 
 
 		 460 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  51.59 
 
 		 460 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  51.97 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  51.97 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  51.97 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  51.97 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  51.97 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  51.97 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  51.97 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  39.66 
 
 		 374 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  40.37 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 368 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  40.06 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  37.89 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 443 aa  209  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  35.31 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  38.08 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.02 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  42.99 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.29 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.52 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  39.6 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  38.64 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  36.26 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  36.26 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  36.26 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  36.26 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  38.01 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  38.35 
 
 		 424 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  35.99 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  37.54 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  34.44 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  38.59 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  34.44 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  34.44 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  36.41 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  34.44 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  34.44 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  34.44 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  34.44 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  36.24 
 
 		 332 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  35.97 
 
 		 372 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  38.34 
 
 		 390 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  36.23 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  34.16 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  38.04 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  38.39 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  40.98 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.46 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  37.82 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  33.61 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  36.91 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  37.29 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  33.78 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  33.06 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  35.19 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  35.86 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.51 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  37.12 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.88 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>