More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1386 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  90.91 
 
 		 411 aa  705    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  90.91 
 
 		 411 aa  705    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  91.17 
 
 		 411 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  83.05 
 
 		 406 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  91.17 
 
 		 411 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  91.17 
 
 		 411 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  90.91 
 
 		 411 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  94.35 
 
 		 404 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  91.17 
 
 		 410 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  84.6 
 
 		 413 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  85.52 
 
 		 420 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 405 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  94.59 
 
 		 404 aa  755    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  94.59 
 
 		 404 aa  755    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  90.91 
 
 		 411 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 407 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  94.35 
 
 		 407 aa  735    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  81.08 
 
 		 424 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  94.59 
 
 		 404 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4021  secretion protein HlyD family protein  71.43 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  67.65 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1214  secretion protein HlyD family protein  66.58 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.314397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2416  secretion protein HlyD family protein  64.76 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  66.31 
 
 		 429 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1293  multidrug resistance A (translocase) transmembrane protein  65.78 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5574  secretion protein HlyD family protein  69.09 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  68.21 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  62.34 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  61.79 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6205  secretion protein HlyD  64.56 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  59.47 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  59.74 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  55.94 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  55.67 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  53.4 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  54.13 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  58.03 
 
 		 448 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  53.49 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  58.45 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  55.08 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  52.85 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  52.06 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  55.94 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  53.98 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  52.21 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  53.73 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  53.09 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  49.87 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  53.09 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  53.09 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  50 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  49.36 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  55.16 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  52.96 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1634  secretion protein HlyD family protein  51.21 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1288  secretion protein HlyD family protein  53.49 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  53.1 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  51.28 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  53.11 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  53.11 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  53.11 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  53.11 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  53.11 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  53.11 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  53.11 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  52.7 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  52.82 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  52.54 
 
 		 390 aa  363  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  49.09 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  49.08 
 
 		 391 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  50.52 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  50.52 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  50.52 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  50.52 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  50.52 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  46.38 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  43.5 
 
 		 387 aa  325  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  43.5 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  43.5 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  43.5 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  43.5 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  43.5 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  43.5 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  43.5 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  43.24 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4219  secretion protein HlyD family protein  53.05 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439503  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4503  secretion protein HlyD family protein  47.84 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  45.41 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  44.48 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3230  secretion protein HlyD family protein  46.92 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5028  secretion protein HlyD family protein  47.58 
 
 		 396 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1853  multidrug resistance transmembrane protein  47.31 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3187  secretion protein HlyD family protein  45.99 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0732  multidrug resistance secretion protein  50.27 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1825  multidrug resistance protein  50.27 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.996701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0368  multidrug resistance protein  50.27 
 
 		 489 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0717  putative multidrug resistance protein  50.27 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.053035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1416  multidrug resistance protein  50.27 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>