More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1624 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  99.24 
 
 		 395 aa  781    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  99.24 
 
 		 395 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  99.24 
 
 		 395 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  99.24 
 
 		 395 aa  781    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  99.24 
 
 		 395 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 395 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  99.24 
 
 		 395 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  79.83 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  73.58 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  79.83 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  79.83 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  78.26 
 
 		 460 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  78.26 
 
 		 460 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  70.76 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  49.74 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  51.68 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  49.37 
 
 		 395 aa  332  9e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  49.22 
 
 		 333 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  36.29 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.71 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  39.03 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 334 aa  212  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.21 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.25 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  35.6 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  37.4 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 400 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  35.42 
 
 		 443 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  36.75 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 368 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  37.88 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 390 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  37.96 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.15 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.3 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  33.96 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  36.29 
 
 		 346 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  36.41 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34.66 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.3 
 
 		 373 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.34 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  40.67 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  36.31 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.25 
 
 		 364 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.88 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.36 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 348 aa  179  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  34.83 
 
 		 391 aa  179  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 		 358 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  35.79 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.87 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  31.59 
 
 		 349 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.55 
 
 		 351 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.36 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  31.07 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  31.07 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  34.89 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  31.07 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  31.07 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  39.39 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  35.75 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  39.51 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.07 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  39.51 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.69 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39.8 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  35.22 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  36.49 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  30.79 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  32.33 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.26 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.09 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  32.66 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 383 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  36.54 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  32.37 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  34.64 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>