More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1375 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  100 
 
 		 374 aa  756    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  70.72 
 
 		 372 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  64.6 
 
 		 368 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  61.92 
 
 		 366 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  64.35 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  61.58 
 
 		 375 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  61.96 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  47.02 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  39.66 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  39.3 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  41.16 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  39.9 
 
 		 400 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  39.69 
 
 		 423 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  43.4 
 
 		 342 aa  224  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  44.7 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.17 
 
 		 393 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  37.46 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  37.46 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 470 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  38.55 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  38.62 
 
 		 475 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 475 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  40.87 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  36.21 
 
 		 359 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  37.18 
 
 		 390 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  39.2 
 
 		 410 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  38.96 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  38.96 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  38.96 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  36.69 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  38.96 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  38.96 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  38.96 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  38.96 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  39.26 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  40.66 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  38.6 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.73 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 		 351 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 352 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  38.44 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  38.68 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  38.97 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  37.32 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  37.99 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  38.65 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  39.14 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  37.32 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  37.32 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  37.57 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  37.32 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  37.32 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  36.49 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  37.32 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  38.65 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  38.15 
 
 		 460 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  38.15 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  35.92 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 		 369 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  36.24 
 
 		 375 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  36.49 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  38.78 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  36.34 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  37.9 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  36.34 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  36.34 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  36.34 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  36.34 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  37.57 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  36.34 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  36.34 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  36.06 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.86 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 		 351 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.74 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.56 
 
 		 351 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  39.54 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  42.11 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  38 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  36.06 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  37.08 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.25 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  37.77 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.56 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  37.82 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  37.77 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>