More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3095 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  100 
 
 
410 aa  830    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  41.19 
 
 
374 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  43.99 
 
 
372 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  40.37 
 
 
401 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  38.75 
 
 
368 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  40.9 
 
 
368 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 
366 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  38.74 
 
 
366 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 
375 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.03 
 
 
366 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  40.45 
 
 
369 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  37.43 
 
 
375 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.97 
 
 
393 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 
423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  38.02 
 
 
475 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  38.02 
 
 
475 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  38.02 
 
 
470 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 
334 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  35.52 
 
 
359 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 
468 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  38.63 
 
 
347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 
460 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  37.47 
 
 
460 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  37.92 
 
 
443 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  39.12 
 
 
400 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 
422 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.37 
 
 
390 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  35.95 
 
 
347 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  37.43 
 
 
333 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.98 
 
 
364 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  35.66 
 
 
343 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.7 
 
 
364 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.7 
 
 
364 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  38.07 
 
 
364 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.42 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  35.7 
 
 
366 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 
380 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  38.07 
 
 
363 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.98 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.74 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.94 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 
363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 
370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 
363 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.54 
 
 
352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
347 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.54 
 
 
352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.55 
 
 
390 aa  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.06 
 
 
387 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.54 
 
 
352 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.54 
 
 
352 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.06 
 
 
387 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.93 
 
 
350 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.54 
 
 
351 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 
411 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  34.89 
 
 
344 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  34.57 
 
 
383 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  36.86 
 
 
349 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  37.02 
 
 
351 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  31.72 
 
 
349 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 
393 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  35.56 
 
 
413 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 
331 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.43 
 
 
364 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.26 
 
 
351 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 
328 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  33.85 
 
 
332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.09 
 
 
355 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  35.44 
 
 
374 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.16 
 
 
348 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 
390 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.64 
 
 
380 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  36.08 
 
 
402 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  34.71 
 
 
342 aa  186  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  34.59 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  35.75 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  33.99 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  33.42 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  33.99 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  33.7 
 
 
406 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  37.02 
 
 
373 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 
395 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  34.25 
 
 
405 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.21 
 
 
400 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  35.34 
 
 
424 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  34.47 
 
 
413 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  33.7 
 
 
407 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  34.25 
 
 
404 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  33.85 
 
 
429 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  34.25 
 
 
404 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  34.25 
 
 
404 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  33.8 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  34.79 
 
 
354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  33.16 
 
 
410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  32.71 
 
 
413 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  35.07 
 
 
420 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>