More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0312 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 400 aa  796    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  59.29 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  72 
 
 		 325 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  66.34 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  46.51 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  48.59 
 
 		 385 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  46.13 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  46.13 
 
 		 380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  45.4 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  44.65 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  45.38 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  42.28 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  42.28 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  42.28 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 352 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  42.28 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  44.93 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  41.36 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 351 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  45.25 
 
 		 378 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  43.46 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.91 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  45.83 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  43.11 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  41.33 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  43.71 
 
 		 404 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.56 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  43.89 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  40.63 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  40.91 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.65 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  40.23 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  41.8 
 
 		 358 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  42.26 
 
 		 374 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  40.88 
 
 		 348 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  42.74 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.23 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 		 395 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  42.36 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  42.36 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  44.56 
 
 		 356 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.85 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 358 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.19 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  41.38 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  42.9 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  41.4 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  41.98 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  42.61 
 
 		 460 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  42.61 
 
 		 460 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  43.35 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  43.77 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  39.3 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  41.72 
 
 		 363 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  41.21 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  43.71 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  39.72 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  43.11 
 
 		 353 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.02 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.4 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 352 aa  203  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  43.37 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  36.76 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 375 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.43 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  42.01 
 
 		 350 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  39.09 
 
 		 393 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  36.99 
 
 		 349 aa  199  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 334 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  36.99 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  34.84 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  39.36 
 
 		 363 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.35 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  42.96 
 
 		 301 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 373 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  38.25 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  38.08 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  34.99 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  38.07 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  44.34 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>