More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3843 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  99.72 
 
 		 352 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 352 aa  706    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  99.72 
 
 		 352 aa  703    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 352 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  91.19 
 
 		 351 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  91.76 
 
 		 351 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  91.48 
 
 		 351 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  78.41 
 
 		 352 aa  551  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  76.07 
 
 		 351 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  87.79 
 
 		 301 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  71.51 
 
 		 364 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  73.64 
 
 		 358 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  64.18 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  43.32 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  45.96 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  43.45 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  45.34 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  44.34 
 
 		 350 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40.76 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 351 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 413 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 421 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  40.54 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  41.9 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  40.3 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  40.77 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 397 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.77 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  41.27 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.56 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.48 
 
 		 375 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  42.28 
 
 		 400 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  40.9 
 
 		 396 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  39.43 
 
 		 341 aa  228  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  41.54 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  41.35 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  42.42 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  39.56 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  40.23 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  39.17 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  40.44 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  42.59 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  42.59 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  42.59 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  40.36 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.94 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.22 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  38.81 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 401 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  39.82 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  38.44 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  41.59 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  41.9 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  41.27 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  38.26 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.27 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.11 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  38.1 
 
 		 352 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 414 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.76 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.31 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.74 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  38.82 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  40.44 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  38.41 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  40.48 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.82 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  40.76 
 
 		 367 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  37.25 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  37.25 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  37.94 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  38.32 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  38.32 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  38.99 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>