More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1992 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  100 
 
 		 344 aa  690    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  98.84 
 
 		 355 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  74.27 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  74.27 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  73.39 
 
 		 351 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  74.34 
 
 		 349 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  73.39 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  43.4 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  42.6 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  44.34 
 
 		 390 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  44.3 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  43.12 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 		 351 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  42.15 
 
 		 414 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.87 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  42.54 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  41.59 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  42.18 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  42.19 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  41.55 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  42.43 
 
 		 358 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  40.81 
 
 		 350 aa  232  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  40.5 
 
 		 381 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  43.26 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 352 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  41.82 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  41.72 
 
 		 394 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  41.33 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.94 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  42.6 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 383 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  39.47 
 
 		 375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  36.25 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  40.92 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  40.82 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  40.31 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  39.36 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  39.17 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  39.05 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.32 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  38.8 
 
 		 421 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 364 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  35.31 
 
 		 347 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  40 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 		 411 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  38.87 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  41.71 
 
 		 374 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  38.28 
 
 		 372 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.03 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.67 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  37.34 
 
 		 393 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  39.03 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  41.32 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.87 
 
 		 368 aa  205  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  44.09 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  36.98 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.75 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  37.35 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.31 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  36.5 
 
 		 358 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 		 367 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 401 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  35.52 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 		 347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.56 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 		 353 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>