More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5486 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  93.96 
 
 		 364 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  99.17 
 
 		 363 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  95.05 
 
 		 364 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  95.3 
 
 		 364 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 363 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  95.3 
 
 		 364 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  90.52 
 
 		 363 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  70 
 
 		 366 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  70.31 
 
 		 375 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  73.53 
 
 		 374 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  54.13 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  49.46 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  51.7 
 
 		 375 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  53.99 
 
 		 390 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  48.42 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  44.8 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  44.18 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  41.1 
 
 		 411 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  41.32 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  44.13 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  43.67 
 
 		 383 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.67 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  43.26 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  41.14 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  45.28 
 
 		 372 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  41.79 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  41.76 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  39.77 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  42.42 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.09 
 
 		 351 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.09 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  39.18 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 351 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  44.27 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  39.76 
 
 		 413 aa  223  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.09 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 		 352 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 		 352 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  40.93 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  40.26 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  41.87 
 
 		 377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  38.03 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  43.98 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  44.11 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  43.44 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  42.36 
 
 		 352 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  43.89 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  42.39 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  39.5 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  41.87 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  41.61 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  41.44 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  44.34 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  44.34 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  44.34 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  41.38 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  41.01 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  42.59 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.83 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  40.69 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 		 387 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 358 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  38.36 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  41.18 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  42.36 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  38.01 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  41.47 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.19 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  43.97 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  43.97 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  43.97 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  42.35 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  38.63 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.99 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 		 460 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 		 460 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  39.68 
 
 		 421 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  39.47 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  39.54 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  38.9 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.53 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  41.14 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  40.86 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  37.09 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>