More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3595 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  100 
 
 		 404 aa  819    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  53.39 
 
 		 372 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  53.14 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  50.7 
 
 		 373 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  50.42 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  52.2 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  55.14 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  55.14 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  55.14 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  50.59 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  51.56 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  48.4 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  50.41 
 
 		 397 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  44.64 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  42.72 
 
 		 414 aa  263  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  44.69 
 
 		 378 aa  262  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  42.6 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.66 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  41.79 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  41.84 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 		 413 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.25 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  40.28 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  40.06 
 
 		 413 aa  242  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  43.84 
 
 		 344 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  41.42 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 351 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 351 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  46.84 
 
 		 388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  41.39 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  40.77 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  42.54 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  42.19 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  40 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  43.11 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  43.89 
 
 		 355 aa  226  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.39 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.62 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.56 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 352 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  40.6 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  37.99 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  40.28 
 
 		 367 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.78 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  36.01 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  41.39 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.99 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 		 402 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  39.69 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.73 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  38.84 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.73 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.73 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.52 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  38.99 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  39.61 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  37.94 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  40.37 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  40.37 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  35.36 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  39.02 
 
 		 358 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  36.49 
 
 		 467 aa  210  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  40.19 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.71 
 
 		 344 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  40.26 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  39.74 
 
 		 342 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  40.55 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  35.92 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  35.96 
 
 		 374 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  34.87 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  37.98 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.42 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  38.84 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>