More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1357 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  100 
 
 		 467 aa  941    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  93.36 
 
 		 463 aa  868    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  71.2 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  45.43 
 
 		 349 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  45.94 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  46.63 
 
 		 354 aa  299  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  45.43 
 
 		 349 aa  299  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  44.38 
 
 		 375 aa  299  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  44.88 
 
 		 387 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  47.24 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  47.45 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  46.06 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  46.06 
 
 		 385 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  48.16 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  45.91 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  45.29 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  45.67 
 
 		 350 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  47.88 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  52.13 
 
 		 358 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  43.21 
 
 		 348 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  44.51 
 
 		 360 aa  242  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  35.99 
 
 		 333 aa  223  8e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  39.41 
 
 		 342 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.19 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  39.23 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  34.39 
 
 		 354 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  34.66 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  37.54 
 
 		 375 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  37.36 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.21 
 
 		 344 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  37.42 
 
 		 404 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  37.69 
 
 		 350 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  34.08 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  35.59 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.54 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 383 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  33.89 
 
 		 366 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 387 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  34.77 
 
 		 381 aa  186  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  36.15 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 372 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 387 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  34.11 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.26 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 363 aa  183  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  34.17 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  37.42 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  37.42 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  37.42 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  33.78 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  34.63 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  36.88 
 
 		 346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  36.19 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 360 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 355 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 363 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  37.62 
 
 		 363 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  36.94 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  38.8 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  38.06 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  34.55 
 
 		 413 aa  177  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 		 349 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  37.22 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  34.3 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  34.6 
 
 		 344 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  33.61 
 
 		 372 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  36.62 
 
 		 349 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  34.29 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.73 
 
 		 375 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  35.12 
 
 		 390 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  33.66 
 
 		 354 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  33.93 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  35.86 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.69 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  33.7 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  33.62 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.98 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  34.06 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  35.29 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  32.23 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  34.9 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  34.15 
 
 		 349 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  34.44 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  34.44 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  34.27 
 
 		 372 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>