More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4248 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 397 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  60.76 
 
 		 386 aa  388  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  53.15 
 
 		 385 aa  328  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  55.35 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  50.96 
 
 		 387 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  50.56 
 
 		 385 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  52.69 
 
 		 350 aa  309  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  50.14 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  50.73 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  50.88 
 
 		 354 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  48.48 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  45.11 
 
 		 467 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  44.24 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  51.75 
 
 		 358 aa  295  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  52.87 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  48.04 
 
 		 349 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  47.73 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  46.57 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  44.17 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  50.14 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  44.68 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  45.9 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  42.99 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.19 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  42.15 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.17 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  42.93 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  38.05 
 
 		 333 aa  219  8.999999999999998e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  40.38 
 
 		 383 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  39.67 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.73 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  43.46 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.51 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 380 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  40.87 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  40.72 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  42.45 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  40.55 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.75 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  37.75 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41.78 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  41.29 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.68 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  42.39 
 
 		 354 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  40.23 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  37.64 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  45.75 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.03 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  45.75 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.36 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  44.77 
 
 		 353 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  38.83 
 
 		 377 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 394 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  38.02 
 
 		 378 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  44.73 
 
 		 397 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  39.15 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  35.35 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  45.42 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  42.77 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  36.55 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  39.87 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  39.43 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.9 
 
 		 400 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.52 
 
 		 364 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  36.84 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  39.58 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  36.25 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  36.64 
 
 		 363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  38.03 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  35.13 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  39.88 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  37.43 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>