More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5067 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 367 aa  708    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  45.77 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  46.25 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  43.06 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  41.89 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  41.91 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  43.8 
 
 		 413 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  41.33 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  43.06 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  42.23 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.76 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.89 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.76 
 
 		 352 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.76 
 
 		 352 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  44.12 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  39.75 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.76 
 
 		 352 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  42.06 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  42.14 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 364 aa  225  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  41.88 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.97 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  42.5 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  44.01 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  41.74 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  42.13 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  42.23 
 
 		 375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  41.1 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  39.81 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.99 
 
 		 375 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  41.25 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.63 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  40.36 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  40.57 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.26 
 
 		 363 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  41.02 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  40.71 
 
 		 342 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 364 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  42.32 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.53 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  40.31 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  41.62 
 
 		 410 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 363 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  39.62 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  39.49 
 
 		 420 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 374 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 344 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  40.72 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  40.46 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  40.72 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  40.72 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  38.86 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  40.72 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.36 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  40.17 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  40.42 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  40.42 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  39.14 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  40.42 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  39.94 
 
 		 373 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.66 
 
 		 390 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  39.7 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  42.48 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  39.89 
 
 		 353 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  40.76 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  39.76 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  40 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  42.3 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  40.88 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  38.2 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  39.71 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  39.41 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  39.41 
 
 		 407 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 		 353 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  37.11 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  39.52 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  42.21 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  42.21 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  38.44 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  42.21 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>