More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2501 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 358 aa  721    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  63.97 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  62.15 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  57.93 
 
 		 352 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  57.28 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  51.68 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  53.23 
 
 		 358 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  52.4 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  52.4 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  54.14 
 
 		 353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  50.3 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  54.78 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  51.74 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  50.81 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  52.46 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  54.78 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 		 360 aa  292  7e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  54.78 
 
 		 353 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  53.75 
 
 		 396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  47.59 
 
 		 349 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  48.34 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  52.55 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  47.18 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  45.93 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  45.4 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  48.08 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  46.02 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.48 
 
 		 414 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  48.04 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 380 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  47.45 
 
 		 344 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.09 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  42.68 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.25 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  44.37 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  37.43 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  41.33 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 406 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.71 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  40.43 
 
 		 344 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.18 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  41.29 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  41.42 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 364 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.78 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  41.1 
 
 		 364 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  41.1 
 
 		 364 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  40.78 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.45 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  43.33 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 387 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.15 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  40.59 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 387 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  42.72 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  41.8 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  39.47 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.42 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  39.54 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  36.83 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.61 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 		 351 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.42 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  40.24 
 
 		 374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  37.68 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  37.38 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  40.74 
 
 		 371 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  34.83 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  34.83 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  38.22 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  40.76 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  38.82 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  38.22 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  38.6 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  34.83 
 
 		 352 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  39.67 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  40.33 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  41.4 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  42.56 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  39.36 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>